Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms