Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNNM3Q8NE01 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM3Q8NE01 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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