Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC21AQ8NDW8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
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TTC21AQ8NDW8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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TTC21AQ8NDW8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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TTC21AQ8NDW8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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TTC21AQ8NDW8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
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TTC21AQ8NDW8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC21AQ8NDW8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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