Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPA2Q8N8Q9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPA2Q8N8Q9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms