Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms