Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVBPQ8N300 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVBPQ8N300 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms