Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMTR1Q8N1G2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms