Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNL3Q8IZI9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNL3Q8IZI9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms