Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMNTD2Q8IXW0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNTD2Q8IXW0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms