Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms