Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN4BQ8IWT1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN4BQ8IWT1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN4BQ8IWT1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN4BQ8IWT1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN4BQ8IWT1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms