Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC50Q8IVM0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC50Q8IVM0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms