Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR49Q8IV35 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms