Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP1Q86WV1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP1Q86WV1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms