Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF39Q86UA1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms