Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF554Q86TJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF554Q86TJ5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms