Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO2Q7Z6W1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO2Q7Z6W1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms