Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z410

TMPRSS9, Transmembrane protease serine 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS9Q7Z410 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS9Q7Z410 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPRSS9Q7Z410 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms