Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG9AQ7Z3C6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG9AQ7Z3C6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG9AQ7Z3C6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG9AQ7Z3C6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG9AQ7Z3C6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG9AQ7Z3C6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG9AQ7Z3C6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms