Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00173Q6ZV60 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms