Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CCDC141Q6ZP82 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC141Q6ZP82 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC141Q6ZP82 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms