Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP12Q6UXS9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms