Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms