Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL35Q6PF15 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL35Q6PF15 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms