Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZCCHC12Q6PEW1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZCCHC12Q6PEW1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZCCHC12Q6PEW1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZCCHC12Q6PEW1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZCCHC12Q6PEW1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms