Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASC4Q6P4E1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASC4Q6P4E1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASC4Q6P4E1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASC4Q6P4E1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASC4Q6P4E1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASC4Q6P4E1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASC4Q6P4E1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASC4Q6P4E1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms