Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP5Q6NZY7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms