Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGMBQ6NW40 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms