Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD4Q6NW29 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RWDD4Q6NW29 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms