Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPRIN2Q6IMN6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPRIN2Q6IMN6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms