Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRAMD4Q6IC98 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRAMD4Q6IC98 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms