Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms