Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf57Q5W0N0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf57Q5W0N0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms