Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF18Q5VWM3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF18Q5VWM3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF18Q5VWM3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF18Q5VWM3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF18Q5VWM3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF18Q5VWM3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRAMEF18Q5VWM3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF18Q5VWM3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms