Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms