Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms