Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms