Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIVEP3Q5T1R4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms