Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC122Q5T0U0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms