Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
FRMPD1Q5SYB0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms