Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN3Q5MJ09 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms