Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms