Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB41Q5JT25 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms