Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms