Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP55Q53EZ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP55Q53EZ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms