Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC38Q502W7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms