Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC1LQ4VXU2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1LQ4VXU2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms