Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01559Q495D7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms