Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP100Q494V2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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