Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL40Q2TBA0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms